Diferitele compoziții ale endotoxinei pot duce la trei forme de fenotip bacterian, și anume tipul neted, tipul aspru și tipul intermediar (numit și tipul de mucus). Când componenta polizaharidă de bază este redusă sau deteriorată, aspectul coloniilor de cultură bacteriană este aspru, deci se numește mutant dur (rough-LPS, R), care poate fi numit Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS în funcție de gradul defectului polizaharidic miez, așa cum se arată în figură .
Microscopul electronic al Escherichia coli LPS cu colonii netede este o structură subțire asemănătoare cordonului, în timp ce tipul brut de Escherichia coli LPS este în mare parte o structură circulară. Datorită lungimii diferite ale lanțului său de zahăr, se vor produce diferite efecte de împiedicare sterică, care vor afecta recunoașterea și fagocitoza LPS și CNB de către celulele imune ale organismului, astfel încât gazda va avea diferite efecte imunitare asupra acesteia și va afecta eliminarea bacteriilor de către organism.
Lanțul de zahăr de tip dur este scurt și este ușor de înghițit de fagocite, cum ar fi fagocitele ocupaționale: neutrofile și macrofage, care sunt ușor de îndepărtat bacteriile de tip aspru; Lanțul neted de zahăr este lung, are obstacole sterice, nu este ușor de înghițit de fagocite și combinat cu complement și este ușor de scăpat de răspunsul imun al organismului la acesta.